Réforme de la facturation électronique : ce que les TPE/PME ont à y gagner

La réforme sur la facturation électronique est fréquemment perçue comme une contrainte administrative. Pour Sylvain Badina, directeur général de Macompta.fr, plateforme agréée par l’État, cette lecture n’est que partiellement vraie. Pour BDM, l’expert-comptable de formation expose ce qu’elle rend possible pour les entreprises qui l’anticipent.

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La réforme : ce que les TPE/PME doivent savoir

Dès le 1er septembre 2026, les entreprises établies en France doivent être en mesure de recevoir des factures électroniques. L’obligation d’émission, elle, entre en vigueur à la même date pour les grandes entreprises et les ETI.

Les TPE et PME disposent d’un délai supplémentaire : leur échéance est fixée au 1er septembre 2027. Les TPE et PME vont donc d’abord recevoir des factures électroniques de leurs fournisseurs grands comptes avant d’avoir à en émettre elles-mêmes.

Les factures PDF envoyées par email ne sont plus conformes. Elles devront être émises dans un format structuré (Factur-X, UBL ou CII) et transiter obligatoirement par une plateforme agréée par l’État. La réforme s’accompagne également d’une obligation d’e-reporting : les données de transaction devront être transmises à l’administration fiscale selon le même calendrier.

Une complexité à ne pas sous-estimer

La réforme sur la facturation électronique est fréquemment perçue comme une simple contrainte administrative. Sylvain Badina invite à aller plus loin. Il explique : « La difficulté de la réforme ne réside pas dans la technique, l’appropriation d’un nouvel outil se fait de plus en plus facilement ». Ce qui est plus exigeant, c’est la remise à plat des process internes : qui reçoit les factures aujourd’hui, qui les traite, qui les valide ? Des questions que formalisent rarement les entreprises.

La réforme implique de réfléchir à ses process actuels, prioritairement de réception des factures, et d’émission dans un second temps. Il convient de réfléchir à qui fait quoi aujourd’hui, et de l’adapter dans le cadre de la réforme. Et pourquoi ne pas en profiter pour améliorer l’organisation.

Changer de logiciel sans revoir son organisation revient donc à risquer de reproduire les mêmes inefficacités dans un cadre réglementaire plus contraignant. La réforme est une occasion de trancher des questions que beaucoup d’entreprises ont laissées en suspens.

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Un enjeu de souveraineté sur les données

La réforme déplace un volume important de données financières vers des plateformes tierces. Pour Sylvain Badina, les TPE et PME ne mesurent pas toujours ce que cela implique. Il précise : « La donnée financière est devenue un actif stratégique. Elle reflète la santé de l’entreprise, ses marges, ses clients et ses fournisseurs. Dans le cadre de la réforme, ces données vont transiter par des plateformes tierces : leur hébergement, leur exploitation et leur protection ne sont donc plus neutres. »

Choisir un hébergement en France, par des prestataires reconnus, c’est s’assurer que les données restent dans un cadre juridique maîtrisé, qu’elles ne sont ni revendues ni utilisées à d’autres fins, et que l’entreprise conserve la maîtrise de ses informations clés sur le long terme.

Le choix d’une plateforme agréée n’est pas une décision anodine : migrer vers une autre solution implique de transférer des données sensibles, de reconfigurer ses intégrations et de reformer ses équipes. Une décision prise dans l’urgence de la mise en conformité peut donc engager l’entreprise pour plusieurs années.

Une opportunité de modernisation inédite

Pour les entreprises qui anticipent, la réforme peut même ouvrir des perspectives concrètes. Selon Sylvain Badina, « anticiper la réforme permet d’en faire un levier de performance ». À condition de ne pas se contenter de cocher la case de la conformité.

Le premier bénéfice est opérationnel. La facturation électronique « facilite l’automatisation comptable, réduit les erreurs de saisie, accélère les délais de paiement et améliore la visibilité sur la trésorerie », précise l’expert. Les tâches les plus chronophages, souvent assurées manuellement dans les petites structures, peuvent ainsi être allégées ou supprimées.

Le second touche à la culture elle-même. « Pour une TPE/PME, c’est aussi l’occasion de structurer ses pratiques de gestion et de piloter son activité en se basant sur des données fiables en temps réel », souligne Sylvain Badina. Moins de décisions prises à l’instinct, plus de capacité à lire ce qui se passe vraiment dans l’entreprise.

Comment bien choisir sa plateforme agréée

Plus d’une centaine de plateformes sont aujourd’hui immatriculées. Un choix abondant, mais qui ne simplifie pas forcément la décision. Sylvain Badina identifie quatre critères à examiner avant de s’engager.

• La simplicité d’usage : pour le directeur général de Macompta.fr, la simplicité de la plateforme est « indispensable pour des équipes peu spécialisées ». Cela passe autant par une interface intuitive que par la qualité de l’accompagnement : tutoriels, webinaires, support disponible en ligne. Dans une TPE où une seule personne gère la comptabilité, pouvoir poser une question et obtenir une réponse rapide d’une équipe basée en France, comme c’est le cas chez Macompta.fr, fait une vraie différence.
• L’interopérabilité : la plateforme doit, selon Sylvain Badina, « s’intégrer facilement avec les outils de gestion et de comptabilité existants dans l’entreprise ». Une solution qui fonctionne en silo génère des ressaisies manuelles et annule une partie des gains attendus de la réforme.
• La fiabilité et la conformité réglementaire : le spécialiste insiste sur la nécessité d’évaluer ces critères « sur la durée, dans un contexte qui va encore évoluer ». Un éditeur solide est celui qui met à jour sa solution au fil des évolutions réglementaires et en informe ses utilisateurs.
• La confiance : Sylvain Badina mentionne deux niveaux de confiance. « La souveraineté des données » d’un côté, et « la capacité de l’éditeur à accompagner les entreprises dans le temps » de l’autre. Le marché des plateformes agréées va se consolider, et toutes les solutions ne survivront pas aux prochaines années.

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Sylvain Badina, Expert comptable et directeur général, Macompta.fr

Sylvain Badina, expert-comptable pendant 25 ans, est Directeur Général de Macompta.fr. L’entreprise développe des outils de gestion en mode SaaS, à destination des chefs d’entreprises et des cabinets d’expertise comptable, en s’appuyant sur la double légitimité de ses équipes : expertise métier et compétences techniques.